Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA3Q9UI47 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms