Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms