Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPASTQ9UBP0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms