Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COMMD8Q9NX08 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMMD8Q9NX08 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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