Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOMER3Q9NSC5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms