Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBQLN4Q9NRR5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBQLN4Q9NRR5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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