Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPHS2Q9NP85 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms