Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZCCHC17Q9NP64 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms