Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR1EQ9GZS1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms