Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms