Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MED18Q9BUE0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED18Q9BUE0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms