Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms