Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RTKNQ9BST9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms