Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms