Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113Q902F9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms