Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PROM2Q8N271 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PROM2Q8N271 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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