Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT78Q8N1N4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KRT78Q8N1N4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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KRT78Q8N1N4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT78Q8N1N4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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