Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCQ7RTU9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCQ7RTU9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms