Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf88Q6PI97 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms