Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REEP3Q6NUK4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms