Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms