Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP188Q5SRE5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms