Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms