Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms