Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms