Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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