Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms