Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GAPVD1Q14C86 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GAPVD1Q14C86 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms