Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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