Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms