Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IFFO1Q0D2I5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms