Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms