Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2P78314 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms