Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms