Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM11AP58511 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM11AP58511 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms