Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIRAP54198 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms