Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPAP53621 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COPAP53621 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms