Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
THOP1P52888 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
THOP1P52888 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
THOP1P52888 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
THOP1P52888 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
THOP1P52888 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
THOP1P52888 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
THOP1P52888 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
THOP1P52888 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
THOP1P52888 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
THOP1P52888 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
THOP1P52888 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
THOP1P52888 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms