Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms