Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms