Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PPARGP37231 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms