Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LINC01432-201ENST00000449427 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ADH5P4-201ENST00000433151 1110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PSMA3-AS1-208ENST00000555275 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC012236.1-202ENST00000558388 1024 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FCER1A-202ENST00000368115 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RN7SKP42-201ENST00000410913 300 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ARHGEF19-AS1-201ENST00000457809 439 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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