Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CMPK1P30085 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms