Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GFAPP14136 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GFAPP14136 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GFAPP14136 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFAPP14136 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFAPP14136 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFAPP14136 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFAPP14136 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFAPP14136 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GFAPP14136 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms