Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRCP08575 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PTPRCP08575 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRCP08575 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRCP08575 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRCP08575 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PTPRCP08575 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PTPRCP08575 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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