Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC1P07992 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms