Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
O00370 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
O00370 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
O00370 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
O00370 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
O00370 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
O00370 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
O00370 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
O00370 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms