Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HNRNPCL3B7ZW38 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HNRNPCL3B7ZW38 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms