Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF316A6NFI3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms