Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOP16Q9Y3C1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms